ПТИЦЕВОДСТВО, 2020, 04, стр 4-9
УДК: 575.116.4:575.2
DOI:10.33845/0033-3239-2020-69-4-4-9
АНАЛИЗ СТРУКТУРЫ НЕРАВНОВЕСИЯ ПО СЦЕПЛЕНИЮ ОДНОНУКЛЕОТИДНОЙ ЗАМЕНЫ SNP2_1 ОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ CR523443 С БЛИЗЛЕЖАЩИМИ ГЕНАМИ НА ЧЕТВЕРТОЙ ХРОМОСОМЕ ДОМАШНЕЙ КУРИЦЫ
Баркова О.Ю.
Всероссийский научно-исследовательский институт генетики и разведения сельскохозяйственных животных - филиал ФГБНУ «Федеральный научный центр животноводства - ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста»
.
Аннотация: Анализ структуры неравновесия по сцеплению однонуклеотидного полиморфизма SNP2_1 последовательности CR523443 с близлежащими генами COMMD, FAM199X на четвертой хромосоме кур породы род-айленд (линии 72, 73, межлинейный гибрид CD) показал высокий уровень неравновесия по сцеплению между SNP2_1 и FAM199X у линии 72 (0,962) и у гибрида CD (0,88). Из полученных данных следует, что наиболее вероятным кандидатом на эффекты QTL является малоизученный пока ген FAM199X, у человека связанный с Х-хромосомой. Мажорный QTL SNP2_1 на четвертой хромосоме кур может быть рекомендован для создания системы QTL, направленных на повышение качества куриного яйца, поскольку оказывает достоверное влияние на массу яйца, упругую деформацию и толщину яичной скорлупы, что позволит ускорить процесс селекции кур-несушек.
Ключевые слова: однонуклеотидный полиморфизм (SNP), локус количественных признаков (QTL), признаки яйца, аллель, куры, неравновесие по сцеплению (LD).
The Analysis of Linkage Disequilibrium between SNP2_1 in CR523443
Sequence and the Adjacent Genes in Chromosome 4 in Chicken
Barkova O.Yu.
Federal Scientific Center for Animal Husbandry of L.K. Ernst
Summary: The analysis of linkage disequilibrium (LD) between the single nucleotide polymorphism SNP2_1 in CR523443 sequence and the adjacent genes in chromosome 4 (COMMD, FAM199X) in different genotypes of Rhode Island chicken (preparental lines UK-72 and UK-73 of UK Kuban-7 cross and parental interline hybrid CD of Lohmann Brown cross) revealed the high levels of LD between SNP2_1 and FAM199X in UK-72 (0.962) and CD (0.880). These results suggest that FAM199X is the most prospective candidate gene for QTL effects; this understudied gene is linked with X chromosome in human. Major QTL SNP2_1 in chromosome 4 in chicken can be recommended for the development of a system of QTL aimed at the improvement of egg quality due to its significant effects on egg weight and on the thickness and strength (elastic deformation) of the eggshell. This system can accelerate the process of selection of laying hens.
Key words: single nucleotide polymorphism (SNP), quantitative trait loci (QTL), egg quality traits, allele, chicken, linkage disequilibrium (LD).
